Fredkullaskolan drivs sedan 1989 av Föreningen för Waldorfpedagogik i Kungälv. Medlemmarna är föräldrar med barn på skolan och skolans medarbetare. Föreningens styrelse ombesörjer skolans drift, ser till att föreningens ändamål uppfylls samt ansvarar för att all verksamhet inom skolans organisation sker i enlighet med gällande lagstiftning. Styrelsen består av både föräldrar och medarbetare och sammanträder på kallelse av ordföranden, i regel var fjärde vecka.